В ходе секретной операции в Гренландском море бесследно исчезает российский подводный крейсер специального назначения. На его поиски отправляется экипаж под руководством Виктора Воронина, чей старший брат командовал пропавшей субмариной.
Морякам предстоит найти подводную лодку и не допустить попадания нового секретного оружия в руки противника. В это же время из-за геологических исследований на полярной станции в северных водах пробуждается Кракен — гигантское чудовище, способное сливаться с тьмой и обладающее высоким интеллектом. Именно с ним предстоит столкнуться морякам, которые ищут пропавшую подводную лодку.